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string的作用揭秘_string类常见的方法(2024年11月焦点)

内容来源：潮汕行网络所属栏目：导读更新日期：2024-11-27

string的作用

终于有人把网络药理学讲明白了！网络药理学：从零到有手就会网络药理学，听起来有点高大上，但其实也没那么复杂。刚开始的时候，我也觉得这玩意儿学不会，但慢慢摸索下来，发现其实只要掌握了几个关键步骤，就能轻松上手。数据库和工具：你的得力助手 TCMSP数据库：这个数据库简直是宝藏，能帮你找到药物的有效成分。 PubChem数据库：预测这些成分的靶点，让你知道药物到底是怎么起作用的。 SwissTarget Prediction：预测靶点，进一步了解药物的作用机制。 Genecards数据库：找到和疾病相关的靶点，确定药物的治疗方向。 OMIM数据库：获取更多疾病相关的信息，让你的研究更全面。软件和流程：让你的研究更高效 Cytoscape软件：构建药物-成分-靶点-疾病网络，清晰展示药物的作用路径。 String数据库：找到交集基因，进一步优化你的网络。 PPI网络：通过蛋白质相互作用网络，深入了解药物的作用机制。 DAVID数据库：进行GO和KEGG富集分析，找出药物的主要作用途径。微生信网站：提供更多生物信息学工具，让你的研究更深入。分子对接：用Autodock和Pymol进行分子对接，找出药物和靶点的具体结合方式。 Openbabel等软件：进行化学结构优化，提高药物的活性。做图软件：让你的研究成果更直观网络药理学的研究离不开各种做图软件，这里推荐几个常用的： Cytoscape：构建网络图，清晰展示药物的作用路径。其他做图软件：根据具体需求选择合适的软件，让你的研究结果更直观。相关文献和资料：让你站在巨人的肩膀上网络药理学系列一（共11讲）：从基础到进阶，逐步掌握网络药理学的核心知识。网络药理学系列二（共14讲）：深入探讨网络药理学的各种应用场景。网络药理学系列三（共15讲）：进一步扩展网络药理学的研究范围和方法。 TCMSP中药网络药理学资料：提供更多中药相关的网络药理学资料，让你对中药的研究更深入。希望这些资料能帮到你，让你的网络药理学研究更上一层楼！𐟚€

生物信息学数据库大集合！𐟌𐟒𛊥œ訿›行生物信息学分析时，各种数据库是不可或缺的资源。以下是一些常用的生物信息学数据库，供大家参考： 𐟓Š 基因组数据库 Ensembl UCSC MGD RGD EcoCyc 𐟔젥Ÿ𚥛 功能研究 KEGG GO Wiki Reactome GeneCards 𐟒ᠧœŸ核生物启动子数据库 EPD 𐟔젥ˆ†子探针数据库 MPDB 𐟔砥䍥ˆ元件数据库 COMPEL 𐟓Š 基因表达数据库 GEO GXD 𐟔 DNA变异数据库 dbVar dbSNP VarScan 𐟒ᠥŸ𚥛 相互作用数据库 BioGRID 𐟔젥Ÿ𚥛 疾病预测数据库 HGMD 𐟌𑠒NA序列相关数据库非编码RNA数据库 starBase NONCODE deepbase IncRNA数据库 IncRNAdb NRED IncRNADisease miRNA数据库 miRBase miRTarBase miRCancer circRNA数据库 circRNABase circBase Circ2Traits 核酸序列预测分析 CENSOR RepeatMasker BLAST RNA与疾病关系数据库 RNADisease 非编码RNA与免疫关系数据库 RNA2Immune RNA修饰关联的读出/擦除/写入蛋白靶标数据库 RM2Target 细菌必需非编码RNA数据库 DBEnRNA 蛋白质相关数据库转录因子调节关系 TRRUST Cistrome TRRD 转录因子结合模式预测 JASPAR 蛋白质结构域数据库 DOMO 蛋白相互作用数据库 STRING HPRD 蛋白质功能分析 InterPro 跨膜蛋白数据库 TMBase 蛋白质突变体数据库 PMD 蛋白质糖基化位点数据库 GLYCBASE 其他数据库疾病相关数据库 OMIM Malacards TCGA GSCA 分子生物标志物数据库 MarkerDB 细胞标志物数据库 singleCellBase、CellMarker、CellTracer、CITEdb、ImmReg、AgeAnno、TIGER、DRESIS、OMIM、Malacards、TCGA、GSCA、MarkerDB、singleCellBase、CellMarker、CellTracer、CITEdb、ImmReg、AgeAnno、TIGER、DRESIS

网络药理学与分子对接：揭秘药物作用机制 𐟌 网络药理学与分子对接技术相结合，为药物研究提供了全新的视角。通过检索中药系统药理学技术平台（TCMSP）、GeneCards、OMIM和DisGeNET等数据库，我们能够筛选出药物的活性成分和与疾病相关的靶点。利用Venny 2.1软件，我们可以进一步筛选出活性成分与疾病的共同靶点。 𐟒ᠥ€Ÿ助STRING数据库，我们构建了药物治疗疾病的蛋白互作网络图。通过Cytoscape 3.8.2软件，对这个网络进行拓扑分析，可以更深入地了解药物的作用机制。 𐟔젥ˆ駔蒨𝯤𛶯𜌦ˆ‘们对药物的活性成分与疾病的共同靶点进行基因本体（GO）功能和京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析。这一步不仅有助于理解药物的作用途径，还能构建成分-疾病靶点-KEGG通路网络图，为药物研发提供有力的理论支持。 𐟓Š 通过这些综合分析，我们能够更全面地了解药物的作用机制，为药物研发和临床应用提供有力的科学依据。

SQL解析JSON，一文搞定！在实际业务场景中，查询数据时经常会遇到JSON数据。今天我们来聊聊如何在SQL中解析这些JSON数据，一起来学习吧！ JSON数据的基本规则 𐟓‘ JSON数据有两种主要的数据类型：对象和数组。对象用花括号{}表示，而数组用方括号[]表示。键值对用冒号:分隔，而数组中的元素用逗号,分隔。 SQL中的JSON数据 𐟓Š SQL中支持JSON格式的数据，这可以减少对非关系型数据库的依赖。JSON类型特别适合存储一些不固定、修改较少、相对静态的数据，比如配置文件和日志记录。解析JSON数据的函数 𐟔 在支持JSON的SQL数据库中，有两个重要的函数可以帮助我们解析JSON数据：JSON_EXTRACT和JSON_UNQUOTE。 JSON_EXTRACT 𐟔 JSON_EXTRACT函数用于从JSON格式的列中提取数据。基本语法如下： JSON_EXTRACT(json_column, path[, path,...]) 解释： json_column：存储JSON数据的列名。 path：一个或多个JSON路径表达式。路径参数说明： $：代表JSON对象的根。 .key：访问对象中的键(key)对应的值。 [index]：访问数组中的元素，索引从0开始。 JSON_UNQUOTE 𐟓œ JSON_UNQUOTE函数的作用是将JSON格式的字符串转换为相应的数据类型。基本语法如下： JSON_UNQUOTE(json_string) 解释： json_string：一个JSON格式的字符串，可能包含数值、布尔值、数组或对象。注意事项 ⚠️ 在处理JSON数组或对象时，JSON_UNQUOTE会返回整个数组或对象作为一个字符串。实战示例 𐟒እ‡设我们有一个存储JSON数据的表，其中一个字段名为@j，包含以下数据： {"email": "amy@only_forjson_udf_test.net", "fruit": ["apple", "pear", "peach"]} 我们可以使用以下SQL语句来提取数据： SELECT JSON_UNQUOTE(JSON_EXTRACT(@j, '$.email')) AS email, JSON_EXTRACT(@j, '$.fruit[0].type') AS fruit_type 输出结果会展示如下： email: amy@only_forjson_udf_test.net fruit_type: ["apple", "pear", "peach"] 解题思路 𐟧 核心是要了解如何使用JSON_EXTRACT和JSON_UNQUOTE这两个函数。JSON_EXTRACT用于提取JSON数据，而JSON_UNQUOTE则用于将JSON格式的字符串转换为相应的数据类型。希望这些信息对你有帮助！如果你有任何问题或需要进一步的解释，欢迎留言讨论哦！

网络药理学：中药现代化的新方向 𐟌🊣## 课程大纲网络药理学的发展历程和研究现状中药网络药理学的基本研究思路中药网络药理学的经典案例分析（SCI）中药复方/单味中药的化学成分筛选药物成分靶点预测疾病靶点预测交集靶点PPI网络构建网络拓扑分析信号通路及生物功能富集分子对接内容简介网络药理学的基本研究思路是通过液质联用或在线中药化学成分数据库（如TCMSP数据库、TCMID数据库、HIT数据库、BATMAN-TCM数据库等）获取中药复方或单位中药的化学成分（研究中药单体可跳过这一步骤）。然后，通过公共数据库（如PharmMapper数据库、SwissTargetPrediction数据库等）或者高通量测序/组学的数据对各成分的蛋白靶点进行预测。接下来，通过疾病数据库（OMIM数据库、Genecards数据库、DisGeNET数据库以及DrugBank数据库等）或者TCGA/GEO获取疾病的靶点信息或者疾病中差异表达的基因。将中药各成分对应的靶点和疾病对应的靶点采用韦恩图取交集，即为中药成分治疗疾病的潜在作用靶点。对交集内的靶点采用String数据库进行PPI网络的构建，最后采用Cytoscape软件构建成分-靶点、靶点-相关互作蛋白的网络进行网络拓扑分析。利用生物信息学网站将潜在作用靶点进行GO、KEGG富集分析，寻找其可能作用的信号通路以及参与的生物学过程，初步揭示中药复方/单味中药/中药单体的作用机制。最后，通过生物学实验进行相关验证。

如何从零开始设计一个景观改造项目？ 𐟎‰ 最近，改造项目越来越多，可见改造已成为一种趋势。今天，我要分享一个特别的改造项目，这次是关于景观设计的。这个项目来自程同学的毕业设计，真是让人眼前一亮。 ⭐ 项目背景：这个毕业设计项目贯穿了程同学研二整年。第一学期，他主要在格拉斯哥城市范围内进行调研，发现问题并尝试提出解决方案。在这个过程中，理论和实践相互促进。他注意到了一些被大卫吉森（David Gissen）定义为“亚自然”（Subnature）的城市元素，比如垃圾、鸽子、被污染的土壤和拥挤的人群等。大卫吉森将人类和城市所产生的不为社会所接受或不属于自然环境的东西定义为subnature，这些元素被市民们排斥，但实际上它们是城市生活的自然产物，是文明社会必须应对的问题。在以多物种繁荣的世界为最终目标的大背景下，这些元素真的毫无价值吗？我们能否找到与之共存的更佳方式呢？ ⭐ 项目概念：程同学认为，片面地认知事物极易导致偏见。我们不能忽略个体所存在的复杂且动态的背景关系网络以及它们在这张网络中的作用。本次设计基于唐纳哈拉维（Donna Haraway）的弦图理论（String figures）和大卫吉森的亚自然理论，通过广泛且深入的研究，探索格拉斯哥这座城市的可能性。 ⭐ 调研与推进：再次去格拉斯哥时，程同学有针对性地调研了几个关键场地，结合可能会在未来被废弃的公路，推测了一个可能的生态栖息地网络。之后，他决定以市中心紧邻火车站的乔治广场为场地深化设计，展示如何在这样一个人类活动高度集中的场地中与亚自然元素互利互惠地和谐共存。 ⭐ 设计部分：广场空间方正且尺度较小，同时在城市中承担着非常重要的“市民中心”（civic heart）的角色。因此，他尝试纵向扩展空间，在营造一个主题鲜明的特色地下空间的同时，仍然能够保留原有广场的功能性。基本的设计原则是把subnature元素转化为商品或景观，并促进它们互利互惠的可持续发展。所以整个场地可以被视为由几个动态系统构成，图中不同颜色的线表示不同的系统。这一系列效果图放大了剖透图中的设计细节，例如种植花园、堆肥设施和让风和雨水进入地下空间的小洞。通过这个项目，我们可以看到景观设计不仅仅是美化环境，更是与城市生活紧密相连，探索人与自然和谐共存的可能性。

Java面试必备：高频八股文整理在准备Java面试时，了解一些常见的高频面试题是非常有帮助的。以下是我整理的一些Java基础相关的面试题，希望对大家有所帮助。一、Java基础概念𐟓š 多态的概念和作用：多态是Java的一个重要特性，允许一个接口在多种方式下使用。面向对象的三大特性：封装、继承和多态。继承与实现的区别：Java不支持多重继承，但可以通过接口实现类似的功能。 Java是引用传递还是值传递：Java中的对象是通过引用传递的。重写与重载的区别：重写是子类对父类方法的一种覆盖，而重载是同一类中多个方法名相同但参数不同的方法。父类、子类的static、非static和构造代码块的执行顺序：了解这些执行顺序可以帮助你更好地理解Java的内存管理。 Java的基本数据类型和引用类型：Java有两种主要的数据类型，基本数据类型和引用类型。 final关键字的作用：final关键字用于声明常量或不可变的变量。数据类型的选择：在Java中，包装类数据类型和基本数据类型各有优劣，选择合适的数据类型可以提高程序的性能。 C/C++与Java的区别：了解这两种语言的不同可以帮助你更好地适应Java的开发环境。二、String类与对象𐟓 类和抽象类的区别：类是具体的事物，而抽象类是一种更高级的概念。抽象类和接口的区别：抽象类不能被实例化，而接口可以。 String的特点：String是不可变的，这意味着它的值一旦设定就不能改变。 String的方法：String的许多方法都与其不可变性有关。 String、StringBuilder和StringBuffer的区别：了解这三种字符串处理方式的不同可以帮助你选择最适合的解决方案。 Integer的比较：Integer的比较是通过比较其值来实现的。 String的不可变性：String是不可变的，但可以通过继承来扩展其功能。 StringBuffer的线程安全性：StringBuffer是线程安全的，因为它使用了同步机制。字符串拼接：了解"+"号在拼接字符串时的行为可以帮助你优化代码。新建String对象：创建String对象时，需要考虑其内存管理。字符串常量池：了解字符串常量池可以帮助你更好地管理内存。多态、接口和继承：多态和接口是Java中非常重要的概念，了解它们的关系可以帮助你更好地理解Java的设计模式。三、Java注解和泛型𐟔 Java反射：反射是Java中一个强大的工具，可以让你在运行时检查和修改代码。自定义注解：了解如何实现自定义注解可以帮助你在代码中添加更多的元数据。泛型的概念：泛型是一种在编译时确定数据类型的机制，可以提供更强的类型检查。泛型擦除：了解泛型擦除可以帮助你更好地理解Java的类型系统。四、Java异常𐟚芊ava的异常体系：Java的异常体系是一个复杂的系统，了解它可以帮助你更好地处理错误。常见的异常类型：Java中有许多不同类型的异常，了解它们可以帮助你更好地管理代码中的错误。 Eror和Exception的区别：Eror是严重错误，通常无法通过程序来处理，而Exception是可以通过程序来处理的错误。五、浮点类型𐟔⊦𕮧‚𙥞‹的存储方式：浮点型数据在内存中是如何存储的，了解这一点可以帮助你更好地理解浮点型的计算方式。浮点型的正负转换：了解浮点型数据的正负转换可以帮助你更好地处理浮点型数据。浮点型的算术运算：了解浮点型数据的算术运算规则可以帮助你编写更准确的代码。

三天速通Java八股，面试加分！ 𐟚€ 如果能在三天内彻底掌握Java八股文，那将是怎样的体验？𐟒ꊊ𐟓š Java基础： Java有几种数据类型？ JVM、JRE和JDK的关系是什么？ Switch支持哪些数据类型？为什么float=3.4会报错？ final关键字的作用是什么？ String有哪些特性？ Stringbuffer和StringBuilder的区别是什么？ =和equals的区别是什么？ hashCode和equals的关系是什么？方法重载和方法重写的区别是什么？ 𐟓Š 数据库优化：数据库三大范式是什么？ B+树和B树的区别是什么？ MylSAM和InnoDB的区别是什么？什么是聚簇索引、非聚簇索引和覆盖索引？除了索引，还有哪些优化SQL的技巧？ NLJ和BNL算法的区别是什么？为什么小表作为驱动表更好？ 𐟒ᠥ䚧𚿧苯𜚊线程、进程、协程的区别是什么？什么是上下文的切换？ Java有几种创建线程的方式？ sleep和wait的区别是什么？ Java的内存模型是什么？保证并发安全的三大特性是什么？ ThreadLocal的原理是什么？什么是CAS锁？ Synchronized锁的原理和优化方法是什么？ synchronized和ReentrantLock的区别是什么？为什么AQS使用双向链表？有哪些常见的AQS类？死锁产生的四个必要条件是什么？如何预防和解除死锁？ CPU密集型和IO密集型的线程数设置有哪些区别？如何停止一个正在运行的线程？如何在两个线程间共享数据？同步代码块和同步方法怎么选？ 𐟌 JVM优化： Java中都有哪些引用类型？ JVM运行时数据区域（内存结构）是什么？ JVM类加载过程是怎样的？ JVM类初始化顺序是怎样的？什么是内存泄漏？什么情况下会内存溢出？ Java的垃圾回收机制是什么？如何判断一个对象是否能够回收？垃圾回收算法有哪些种类？ 32位和64位的JVM中，int类型变量的长度是多少？ JRE、JDK、JVM及JIT之间的关系是什么？解释Java堆空间及GC的工作原理。如何获取Java程序使用的内存和堆使用的百分比？描述一下JVM加载class文件的原理机制。什么时候会触发FullGC？ JVM的永久代中会发生垃圾回收吗？你知道哪些JVM性能调优技巧？ 𐟌𑠓pring框架：什么是Spring框架？它的两大核心概念是什么？ Spring框架的设计目标、设计理念和核心是什么？ Spring的优缺点是什么？ Spring有哪些应用场景？ Spring由哪些模块组成？ Spring框架中都用到了哪些设计模式？详细讲解一下核心容器（Spring Context应用上下文）模块。 Spring框架中有哪些不同类型的事件？ Spring应用程序有哪些不同组件？使用Spring有哪些方式？解释JDBC抽象和DAO模块。解释对象/关系映射集成模块。什么是Spring IOC容器？ Bean工厂和Application Contexts有什么区别？ Spring框架中的单例Bean是线程安全的吗？解释Spring框架中Bean的生命周期。在Spring框架中如何更有效地使用JDBC？ Spring支持的ORM有哪些？ Spring支持的事务管理类型有哪些？ 𐟐𞠒edis： Redis有哪几种基本的数据类型？ Redis的持久化机制是什么？ Redis是单线程的吗？为什么单线程还能处理那么多并发客户端连接？什么是缓存穿透、缓存击穿和缓存雪崩？Redis集群方案是什么？Redis集群主从同步原理是什么？Redis集群选举原理分析是什么？TCP/IP和UDP模型的区别是什么？从输入地址到获得页面的过程是怎样的？TCP进行三次握手的原理是什么？采用两次握手行吗？可以采用四次握手吗为什么？TCP如何保证可靠性的？

网络药理学分析全流程详解网络药理学是一种结合了计算机科学、生物信息学和药物化学的新兴领域，主要用于研究药物与疾病之间的关系。以下是网络药理学分析的基本步骤： 𐟌🠦˜Ž确药物与疾病：首先，确定要研究的中药及其对应的疾病。可以通过查阅相关文献或使用TCMSP数据库来查找药物成分。 𐟔 确定成分靶点：在TCMSP数据库中筛选药物的靶点，或者利用PubChem和Swiss等平台预测靶点。 𐟏堧ᮥ–𞧗…靶点：在OMIM、Genecards和Drugbank等数据库中搜索与疾病相关的靶点。 𐟔„ 找出交集靶点：通过韦恩图分析，找出药物成分靶点和疾病靶点的交集。 𐟌 构建PPI网络：将交集靶点蛋白导入String数据库，构建蛋白质相互作用网络。 𐟓ˆ GO和KEGG分析：在Metascape网站上进行GO和KEGG分析，了解药物在特定通路中的作用。 𐟔젥ˆ†子对接：选取与疾病最相关的靶点蛋白，与对应的小分子进行对接，计算结合能。 𐟖𜯸 整理分析图：整理并美化分析结果图，如韦恩图、PPI网络图等。这些步骤是网络药理学分析的基础，通过这些步骤可以更深入地理解药物与疾病之间的关系。欢迎大家共同探讨和交流！

生信分析必备：十大数据库推荐 𐟔在生物信息学分析中，数据的质量和丰富度至关重要。今天，我想和大家分享一些在生信分析中常用的数据库，它们就像是你的得力助手，帮助你更好地理解和解析生物数据。 NCBI NCBI（National Center for Biotechnology Information）是一个宝藏库，包括了GenBank核酸序列数据库和PubMed文献数据库等众多资源。无论你是要查找特定的基因序列，还是想要了解某个基因的功能，NCBI都是你的不二之选。 UniProt UniProt数据库提供了大量的蛋白质序列和功能信息。如果你正在研究某个特定蛋白质的结构域或者修饰位点，UniProt绝对是你的好帮手。 Ensembl Ensembl整合了基因组、转录组和蛋白质组等多组学数据，让你能够轻松获取基因的注释和变异信息。无论是基因表达分析还是基因突变研究，Ensembl都是你的得力助手。 TCGA TCGA（The Cancer Genome Atlas）存储了大量的癌症相关基因组和转录组数据。对于癌症研究者来说，TCGA是一个不可多得的数据宝库。 GEO GEO（Gene Expression Omnibus）包含了各种基因表达数据。无论你是研究特定疾病状态下的基因表达变化，还是想要了解某个基因在不同条件下的表达模式，GEO都能满足你的需求。 KEGG KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes）提供了代谢通路和信号通路等信息。通过KEGG，你可以清晰地了解基因在通路中的作用，这对于理解生物过程非常重要。 STRING STRING（Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins）用于预测蛋白质之间的相互作用。如果你正在研究蛋白质互作，STRING可以为你提供方向。 dbSNP dbSNP（Database of Single Nucleotide Polymorphisms）收集了单核苷酸多态性（SNP）的数据。SNP是基因组变异的重要形式，dbSNP为你提供了丰富的SNP数据资源。 MINT MINT（Molecular INTeraction database）专注于蛋白质互作数据。它的数据精准且专业，是研究蛋白质互作的重要工具。 Reactome Reactome涵盖了生物过程和分子相互作用的通路信息。无论你是想了解某个特定通路的细节，还是想要探索新的生物过程，Reactome都是你的好帮手。 𐟌Ÿ这些数据库为我们的生信分析提供了强大的数据支持，记得收藏起来，以备不时之需！如果你对复杂的生信数据感到头疼，或者担心数据分析会耗费你宝贵的研究时间，不妨告诉我你的研究方向，我会尽力帮你少走弯路。毕竟，科研时间对于我们来说才是最关键的！

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